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章惇他们走后，赵佶拿着一本国史和太宗实录翻看着，他此时正在查看关于水师的各种记录。
其实宋军并非不重视水师，自从大宋开国，为了削平南方的割据政权，大宋组建了数支水军，太祖皇帝还开凿了金明池，用以操练水军，开国名将曹彬就是善用水军的名将。
但是随着宋军削平南方的这些的割据政权，水军的作用就不太大了，再加上宋军后来的主要对手西夏、契丹都在北方，水军没有什么用武之地，宋军的水军也就逐渐荒废下来了。
现下宋军水师只有禁军水军，有神卫水军和殿前司、步军司的两支虎翼水军，以及澄海水军弩手等四支水军。其中澄海水军弩手和平海军驻扎在登州，其余禁军水军都驻扎在东京，早就沦为表演杂技的弄潮儿了。
倒是在南方，宋军组建了一大批厢军水军，北自陕西，南到广南西路，凡有河湖海水的地方，宋军都设置了厢军水军，不过这些水军大多是维持治安，剿灭地方水匪盗贼，保障漕运航道的，战斗力并不强，而且并没有统一指挥，禁军水军分属殿前司步军和侍卫步军司管理，地方厢军的水军，有的在诸路经略安抚使的管辖下，有的在诸路兵马都监辖下，还有的归属州府主官管理。
赵佶决意在三衙设立一个专门管理全国水军的衙门，将禁军水军，厢军水军中一些有战斗力的水军都编入进去，还有未来设立的缉私水军，都要纳入这个机构的管理，但是一来是三衙是祖制，要是赵佶妄动，搞不好又得挨喷，赵佶在实录里翻找着，看看能不能找到什么灵感。
忽然他在太宗实录里翻看到一条记录，雍熙二年六月，诏罢侍卫亲军司马步军都指挥使米信 ，此后不复见置。赵佶突然想起这条了，三衙的全称是两司三衙，即殿前司和侍卫亲军司为两司，殿前都指挥使司、侍卫亲军步军指挥使司、侍卫亲军马军指挥使司合称三衙，本来两司的长官殿前都检点和侍卫亲军司马步军都指挥使是禁军最高统帅。
但是本朝太祖就是在殿前都检点的位置上做了天子，所以继位之后殿前都检点很快就被废除了，太宗朝时，认为侍卫亲军司权柄过重，于是也废除了，两司三衙就彻底变成了三衙，如果在保留三衙体制的情况下，应该可以恢复侍卫亲军司，但是就不再叫侍卫亲军司，与殿前都指挥使司对应，应该叫侍卫亲军马步军都指挥使司，再设立一个水军都指挥使司，不还是三衙吗？机智如我。
赵佶说干就干，当即召集政事堂和两制以上重臣讨论此事，赵佶开宗明义的说道：现下各地市舶司渐次开展，水军造船也要展开，水军肩负打击海盗水匪，查禁走私的重任，宜升格为禁军，专设一司统帅，吾意将侍卫亲军马军都指挥使司和侍卫亲军步军都指挥使司合并为侍卫亲军马步军都指挥使司，再新设水军都指挥使司，仍为三衙，诸位意下何如？
苏辙问道：若是和侍卫马军司与侍卫步军司，那不就是侍卫亲军司吗？侍卫亲军司权柄过重，不宜重设，且水军现在殿前司、侍卫步军司辖下管理，不若沿袭旧制，仍归殿前、侍卫步军司管理即可，单设水军都指挥使司，似乎并无必要。
苏辙的话得到了大部分重臣的支持，部分台谏老牌谏官，甚至当场失控，准备给赵佶上课，痛陈五代时武夫跋扈，祸乱国家的历史，尤其是侍卫亲军司，后汉时期，侍卫亲军都指挥使史弘肇专擅军政大权，侍卫司权力空前膨胀，与宰相 、枢密使并执国政，甚至参与政变，高举祖制，以文御武，痛陈赵佶的做法是取祸之道。
赵佶做皇帝也不短了，身上渐渐有了点威势，尤其是刚刚打服了李乾顺，当即拂袖而去，同时召政事堂诸公垂拱殿商议。
来到垂拱殿，韩忠彦、苏辙还是坚持不设立水军都指挥使司，曾布、章惇、吕惠卿还没有表态，赵佶问道：计相，执掌三司，现在各处市舶司怎样？
吕惠卿愣了一下还是说道：诸路市舶一如往年，不过据报，市舶征税每年都在提升，赵佶点点头说道：诸位也都知道，水军现下最大的作用就是查缉走私，保障市舶司收入，若不专设机构管理，市舶司处水军，长期与市舶司勾连，甚至与不法商贾勾结，放任走私，侵吞国帑，甚至勾结海盗，为非作歹，不但国朝税收受损，于国家更是大为不利，水军与其他禁军一样，一是置将操练，二是行更戍之法，尤其是缉私水军，更是要严加管束，若不专设一司，如何管理？
赵佶说到这个，诸位宰相也是若有所思，若是还是和现在一样，将新设的水军放任地方，由州县长官和市舶使管理驱使，必然与他们互相勾结，倒是侵吞税款倒是小事，要是真有胆大包天之辈，做出些大逆不道的事情，也未可知。
赵佶接着说道：至于侍卫亲军马步军司，其实大可不必担心，现在本朝兵柄，尽在枢密院，驻泊禁军和就粮禁军，虽在侍卫亲军马步二司麾下，实际上以由诸路帅臣指挥，二司无能为也，至于都门禁军，侍卫马步二司虽掌部分，但还有殿前司、诸班直、皇城司，根本不用担心，且时移事易，非是当年了。
其实章惇等人根本不相信设立一个侍卫亲军马步军司就能威胁到什么，而今天下兵柄，都在枢密院手中，三衙武帅不过统兵训练而已，置将操练后，枢密院直接指挥到各将，三衙的作用就更低了，而且三衙武帅，多是将门武臣，忠诚还是没有问题了。
他们只是单纯觉得水军没什么大用罢了，但是赵佶将水军和市舶司收入联系在一起，这就不得不让人深思了，章惇想了想说道：官家，眼下水军并不强大，单设一司，似乎难以服众，不若将水军全部划入殿前司，设立殿前水军司，由殿前都虞侯兼任，待水军强大后，再论单设一司之事。
赵佶想想也是，关键是将水军变成一个独立军种，提高水军地位，让水军不再是马步军的附属才是关键，赵佶于是点头说道：枢相说的在理，将禁军水军、厢军水军中的精锐，各沿海水军、新设的缉私水军一并划入殿前水军司，命将管理，各水军一样置将操练，同时上报船只、军器等物。