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天地之初，处于“混沌”状态，有名为“盘古”之人生于其间。
盘古虽是主宰，但也避免不了身体的不断成长，至此，原来的混沌状态被打破，因不能容纳其身体而分裂，其中之“清气”上升为天，“浊气”则是沉降为地。
盘古死后，其精、气、神分化成为不同的形态存在，分别是伏羲、神农、女娲三位大神（也被称为三皇）。
因天地间生灵太少，三皇分别以不同形式创造生灵。
伏羲以神树吸收神界清气所结的果实为躯体，注入自己强大的精力，创造出“神”。
由于神树果实来源稀少，因此神的数量极少，但灵力强大。神不耐大地浊气，因此居于天，形成“神界”。
神虽然有男女之分，但交合繁衍后神本体会失去灵力逐渐死亡，而不能增加神的数量，因此被严禁交合繁衍。
神农以大地土石草木为体，灌注自身气力，创造出“兽”（包括走兽昆虫）。
因神农注重数量和能力，因此兽的种类、数量很多，且能力多样，但是心智却没有开发。
女娲以土、水混合，附以自身血液和灵力，用杨柳枝条点化，依自己模样塑造，造出“人”。
人体态优美，富有智慧，但体力较逊，虽然没有特别的能力，但领悟力极强。
神居于天，人、兽居于地，另有“鬼界”作为人、兽等生灵的轮回中转之所。
数万年来相安无事。
后因人、兽过度繁衍，时有冲突，三皇之一的神农在人间暴毙，据说是因尝百草中毒而死。
不久，兽类中出现了一个具有极高智慧的统御者蚩尤。
蚩尤率领兽族向人类开战，意图独占大地。人类取得神族援手，在神将轩辕氏的指挥下击败蚩尤大军。
蚩尤拼尽余力，打开异界通道，将残部送达异界，蚩尤残部在异界逐渐修炼成魔，“魔界”也逐渐形成。
之后因为各人的种类形态不同，魔界又分成了八国，如夜叉、罗刹、修罗等。本作中的龙樊便是来自魔界夜叉。
神界之主伏羲自封“天帝”，封闭了天界之门，迫使人类皇帝向自己称藩。
女娲则与人类男子交合，生下了特殊的种族女娲族，不久女娲就意外地力竭而死了，本作中林若羽便是女娲后人。
魔界的蚩尤则自封为“魔尊”对抗神界。
兽类中偶有经过修炼，激发出自身继承的神农力量，成为具有特殊能力的“妖”。
而人类经过修炼也能激发出自身继承的女娲灵力，修成为“仙”。
妖和仙的形成除了和天赋以及修炼有关外，还和地气有关。
因此天上便有了“仙界”，人间也有十大洞天、三十六小洞天、七十二福地等“仙界”，其中最著名的仙界就是盘古之心所在的“蜀山仙剑派”。
六界之间，虽然有封印阻隔，但五灵气脉仍互相连通。
数万年前，神魔之井动荡，六界水脉紊乱，后被蜀山七圣和一个仙资卓越的少年封印，水脉也渐渐恢复正常。
如今，神魔之井封印再度进入薄弱期，六界裂隙即将生成，夜叉族人不免又生起侵占人间之心。
故事，也从这里开始。